Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms