Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Znf48Q3US17 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Znf48Q3US17 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Znf48Q3US17 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Znf48Q3US17 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Znf48Q3US17 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Znf48Q3US17 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Znf48Q3US17 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Znf48Q3US17 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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