Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms