Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms