Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rmi2Q3UPE3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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