Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms