Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Usp30Q3UN04 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Usp30Q3UN04 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Usp30Q3UN04 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms