Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mccc2Q3ULD5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms