Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpr55Q3UJF0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms