Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Sf3b2Q3UJB0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b2Q3UJB0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms