Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms