Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zyg11bQ3UFS0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms