Protein–RNA interactions for Protein: Q3U7U4

Transmembrane protein C1orf162 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U7U4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U7U4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U7U4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U7U4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U7U4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U7U4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U7U4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U7U4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U7U4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U7U4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U7U4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U7U4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U7U4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U7U4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U7U4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U7U4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U7U4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U7U4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U7U4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q3U7U4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U7U4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U7U4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U7U4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U7U4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U7U4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U7U4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U7U4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U7U4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U7U4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U7U4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U7U4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U7U4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U7U4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U7U4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U7U4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U7U4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U7U4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U7U4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Q3U7U4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3U7U4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3U7U4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Q3U7U4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3U7U4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Q3U7U4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3U7U4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3U7U4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U7U4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U7U4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U7U4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U7U4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q3U7U4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U7U4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U7U4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U7U4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U7U4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U7U4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U7U4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U7U4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U7U4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U7U4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U7U4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U7U4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U7U4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U7U4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U7U4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U7U4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U7U4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U7U4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U7U4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U7U4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U7U4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U7U4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U7U4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U7U4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U7U4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U7U4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U7U4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U7U4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U7U4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U7U4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U7U4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U7U4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U7U4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U7U4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U7U4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U7U4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U7U4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U7U4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U7U4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U7U4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U7U4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U7U4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U7U4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q3U7U4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U7U4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U7U4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U7U4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U7U4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U7U4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U7U4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms