Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U595 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U595 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U595 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U595 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U595 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U595 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U595 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U595 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U595 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U595 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U595 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U595 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U595 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U595 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U595 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U595 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U595 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U595 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U595 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U595 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U595 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U595 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U595 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U595 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U595 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U595 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U595 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U595 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U595 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U595 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U595 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U595 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U595 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U595 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U595 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U595 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U595 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U595 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U595 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U595 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U595 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U595 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U595 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U595 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U595 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U595 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U595 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U595 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U595 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U595 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U595 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U595 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U595 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U595 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U595 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U595 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U595 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U595 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U595 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U595 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U595 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U595 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U595 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U595 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U595 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U595 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U595 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U595 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U595 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U595 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U595 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U595 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U595 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U595 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U595 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U595 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U595 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U595 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U595 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U595 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U595 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U595 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U595 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U595 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U595 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U595 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U595 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U595 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U595 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U595 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U595 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U595 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U595 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U595 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U595 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U595 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U595 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U595 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U595 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms