Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Palb2Q3U0P1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms