Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hace1Q3U0D9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms