Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms