Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf3c3Q3TMP1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms