Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms