Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrx1Q3TL44 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrx1Q3TL44 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrx1Q3TL44 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrx1Q3TL44 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrx1Q3TL44 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrx1Q3TL44 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrx1Q3TL44 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrx1Q3TL44 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrx1Q3TL44 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrx1Q3TL44 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrx1Q3TL44 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrx1Q3TL44 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrx1Q3TL44 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrx1Q3TL44 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrx1Q3TL44 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrx1Q3TL44 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrx1Q3TL44 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrx1Q3TL44 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrx1Q3TL44 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrx1Q3TL44 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrx1Q3TL44 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrx1Q3TL44 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrx1Q3TL44 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrx1Q3TL44 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrx1Q3TL44 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrx1Q3TL44 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrx1Q3TL44 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms