Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms