Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms