Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2f1Q3THK3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms