Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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