Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms