Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms