Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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