Protein–RNA interactions for Protein: Q149C3

Lingo4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain containing-NOGO receptor-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo4Q149C3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lingo4Q149C3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms