Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms