Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms