Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms