Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms