Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms