Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms