Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms