Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MitfQ08874 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MitfQ08874 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms