Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp2Q08652 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp2Q08652 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp2Q08652 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp2Q08652 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp2Q08652 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp2Q08652 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp2Q08652 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp2Q08652 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp2Q08652 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp2Q08652 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp2Q08652 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp2Q08652 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp2Q08652 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp2Q08652 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp2Q08652 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp2Q08652 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp2Q08652 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp2Q08652 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp2Q08652 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp2Q08652 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp2Q08652 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp2Q08652 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rbp2Q08652 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rbp2Q08652 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Rbp2Q08652 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rbp2Q08652 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rbp2Q08652 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rbp2Q08652 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp2Q08652 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms