Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc4Q08624 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc4Q08624 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc4Q08624 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc4Q08624 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc4Q08624 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms