Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms