Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou6f1Q07916 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms