Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AmbpQ07456 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms