Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cab39Q06138 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cab39Q06138 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cab39Q06138 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cab39Q06138 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cab39Q06138 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cab39Q06138 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cab39Q06138 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cab39Q06138 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cab39Q06138 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cab39Q06138 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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