Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms