Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms