Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top1Q04750 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Top1Q04750 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top1Q04750 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top1Q04750 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Top1Q04750 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Top1Q04750 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms