Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms