Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Runx1Q03347 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms