Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fgfr4Q03142 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms