Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms