Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms